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我站与清华大学刘晓教授课题组合作开发pBACode 库取得新进展

发布时间:2017-11-16  发布者:  字体大小:【加大  减小】  【打印】

我站积极拓展科研项目合作渠道,与清华大学刘晓教授课题组开展科研合作开发pBACode 库,建立牙鲆基因组物理图谱,目前牙鲆研究已生成了初步基因组序列草图和遗传图谱。本项目是开发一种新的高通量BAC库两端测序方法,建立牙鲆基因组物理图谱,基于2014年我站创制的牙鲆克隆系,利用序列标签(Barcode pairs)技术,构建了牙鲆pBACode 库。BAC库包含94,464克隆,每个克隆基因组插入片段长度平均为150kb,其中95.4%的克隆具有序列标签序列,通过barcodes高通量测序定位每一个克隆的位置。我站创制的牙鲆克隆系纯合度大于99 %,非常适合用于基因组组装,结合BAC末端测序进行基因组预装配,装配质量可提高10倍以上,该成果现已发表在?Nucleic Acids Research(IF9.58)(DOI: 10.1093/nar/gkw1261)。

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